STMN1

Ідентифікатори

Символи

STMN1, C1orf215, LAP18, Lag, OP18, PP17, PP19, PR22, SMN, stathmin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 151442 MGI: 96739 HomoloGene: 4063 GeneCards: STMN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal transducer activity • tubulin binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • цитоплазма • цитоскелет • мікротрубочка • мембрана • гіалоплазма • екзосома • neuron projection
Біологічний процес	• нейробіологія розвитку • GO:0043148 mitotic spindle organization • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:0007243 intracellular signal transduction • response to virus • аксоноґенеза • neuron projection development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • brain development • mitotic cytokinesis • microtubule depolymerization • regulation of microtubule polymerization or depolymerization • negative regulation of microtubule polymerization • negative regulation of Rho protein signal transduction • hepatocyte growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of stress fiber assembly • establishment of skin barrier • negative regulation of thrombin-activated receptor signaling pathway • negative regulation of guanyl-nucleotide exchange factor activity • regulation of cytoskeleton organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3925


16765

Ensembl


ENSG00000117632


ENSMUSG00000028832

UniProt


P16949


P54227

RefSeq (мРНК)


NM_203401 NM_001145454 NM_005563 NM_152497 NM_203399


NM_019641

RefSeq (білок)


NP_001138926 NP_005554 NP_981944 NP_981946


NP_062615

Локус (UCSC)

Хр. 1: 25.88 – 25.91 Mb

Хр. 4: 134.2 – 134.2 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STMN1 (англ. Stathmin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 149 амінокислот, а молекулярна маса — 17 303^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASSDIQVKE	LEKRASGQAF	ELILSPRSKE	SVPEFPLSPP	KKKDLSLEEI
QKKLEAAEER	RKSHEAEVLK	QLAEKREHEK	EVLQKAIEEN	NNFSKMAEEK
LTHKMEANKE	NREAQMAAKL	ERLREKDKHI	EEVRKNKESK	DPADETEAD

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Maucuer A., Doye V., Sobel A. (1990). A single amino acid difference distinguishes the human and the rat sequences of stathmin, a ubiquitous intracellular phosphoprotein associated with cell regulations. FEBS Lett. 264: 275—278. PMID 2358074 DOI:10.1016/0014-5793(90)80266-L
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brattsand G., Marklund U., Nylander K., Roos G., Gullberg M. (1994). Cell-cycle-regulated phosphorylation of oncoprotein 18 on Ser16, Ser25 and Ser38. Eur. J. Biochem. 220: 359—368. PMID 8125092 DOI:10.1111/j.1432-1033.1994.tb18632.x
Leong W.F., Chow V.T. (2006). Transcriptomic and proteomic analyses of rhabdomyosarcoma cells reveal differential cellular gene expression in response to enterovirus 71 infection. Cell. Microbiol. 8: 565—580. PMID 16548883 DOI:10.1111/j.1462-5822.2005.00644.x
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Melhem R.F., Zhu X., Hailat N., Strahler J.R., Hanash S.M. (1991). Characterization of the gene for a proliferation-related phosphoprotein (oncoprotein 18) expressed in high amounts in acute leukemia. J. Biol. Chem. 266: 17747—17753. PMID 1917919

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6510 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P16949 (англ.) . Архів оригіналу за 25 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3