DAG1

DAG1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1EG4, 2MK7

Ідентифікатори
Символи DAG1, 156DAG, A3a, AGRNR, DAG, MDDGC7, MDDGC9, MDDGA9, dystroglycan 1, LGMDR16
Зовнішні ІД OMIM: 128239 MGI: 101864 HomoloGene: 3234 GeneCards: DAG1
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2P, muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type A, 9[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium ion binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• virus receptor activity
• alpha-actinin binding
• vinculin binding
• actin binding
• tubulin binding
• structural constituent of muscle
• SH2 domain binding
• laminin binding
• laminin-1 binding
• dystroglycan binding

Клітинна компонента

• cell-cell junction
• клітинне ядро
• синапс
• contractile ring
• Філоподія
• node of Ranvier
• costamere
• lamellipodium
• dystroglycan complex
• membrane raft
• міжклітинні контакти
• цитоскелет
• мембрана
• екзосома
• basolateral plasma membrane
• postsynaptic membrane
• Сарколема
• цитоплазма
• integral component of membrane
• focal adhesion
• клітинна мембрана
• dystrophin-associated glycoprotein complex
• нуклеоплазма
• базальна мембрана
• гіалоплазма
• міжклітинний простір
• endoplasmic reticulum lumen
• Golgi lumen
• plasma membrane raft
• external side of plasma membrane
• nuclear periphery
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• extracellular region
• collagen-containing extracellular matrix
• glutamatergic synapse
• GABA-ergic synapse
• postsynaptic cytosol

Біологічний процес

• NLS-bearing protein import into nucleus
• extracellular matrix organization
• GO:0022415 viral process
• regulation of embryonic cell shape
• response to peptide hormone
• regulation of epithelial to mesenchymal transition
• positive regulation of basement membrane assembly involved in embryonic body morphogenesis
• viral entry into host cell
• regulation of gastrulation
• negative regulation of cell migration
• Schwann cell development
• membrane protein ectodomain proteolysis
• calcium-dependent cell-matrix adhesion
• negative regulation of MAPK cascade
• nerve maturation
• microtubule anchoring
• commissural neuron axon guidance
• branching involved in salivary gland morphogenesis
• negative regulation of protein kinase B signaling
• morphogenesis of an epithelial sheet
• myelination in peripheral nervous system
• basement membrane organization
• epithelial tube branching involved in lung morphogenesis
• modulation by virus of host process
• protein O-linked glycosylation
• positive regulation of cell-matrix adhesion
• GO:0010260 старіння людини
• Schwann cell differentiation
• response to denervation involved in regulation of muscle adaptation
• nerve development
• axon regeneration
• positive regulation of myelination
• skeletal muscle tissue regeneration
• positive regulation of protein kinase activity
• positive regulation of oligodendrocyte differentiation
• cellular response to mechanical stimulus
• cellular response to cholesterol
• angiogenesis involved in wound healing
• GO:1904739 regulation of synapse organization
• regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane
• retrograde trans-synaptic signaling by trans-synaptic protein complex

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1605
13138
Ensembl
ENSG00000173402
ENSMUSG00000039952
UniProt
Q14118
Q62165
RefSeq (мРНК)
NM_004393
NM_001165928
NM_001177634
NM_001177635
NM_001177636
NM_001177637
NM_001177638
NM_001177639
NM_001177640
NM_001177641
NM_001177642
NM_001177643
NM_001177644
NM_001276481
NM_001276482
NM_001276485
NM_001276486
NM_001276492
NM_001276493
NM_001276494
NM_010017
RefSeq (білок)
NP_001159400
NP_001171105
NP_001171106
NP_001171107
NP_001171108
NP_001171109
NP_001171110
NP_001171111
NP_001171112
NP_001171113
NP_001171114
NP_001171115
NP_004384
NP_001263410
NP_001263411
NP_001263414
NP_001263415
NP_001263421
NP_001263422
NP_034147
Локус (UCSC) Хр. 3: 49.47 – 49.54 Mb Хр. 9: 108.08 – 108.14 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DAG1 (англ. Dystroglycan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 895 амінокислот, а молекулярна маса — 97 441[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRMSVGLSLLLPLSGRTFLLLLSVVMAQSHWPSEPSEAVRDWENQLEASM
HSVLSDLHEAVPTVVGIPDGTAVVGRSFRVTIPTDLIASSGDIIKVSAAG
KEALPSWLHWDSQSHTLEGLPLDTDKGVHYISVSATRLGANGSHIPQTSS
VFSIEVYPEDHSELQSVRTASPDPGEVVSSACAADEPVTVLTVILDADLT
KMTPKQRIDLLHRMRSFSEVELHNMKLVPVVNNRLFDMSAFMAGPGNAKK
VVENGALLSWKLGCSLNQNSVPDIHGVEAPAREGAMSAQLGYPVVGWHIA
NKKPPLPKRVRRQIHATPTPVTAIGPPTTAIQEPPSRIVPTPTSPAIAPP
TETMAPPVRDPVPGKPTVTIRTRGAIIQTPTLGPIQPTRVSEAGTTVPGQ
IRPTMTIPGYVEPTAVATPPTTTTKKPRVSTPKPATPSTDSTTTTTRRPT
KKPRTPRPVPRVTTKVSITRLETASPPTRIRTTTSGVPRGGEPNQRPELK
NHIDRVDAWVGTYFEVKIPSDTFYDHEDTTTDKLKLTLKLREQQLVGEKS
WVQFNSNSQLMYGLPDSSHVGKHEYFMHATDKGGLSAVDAFEIHVHRRPQ
GDRAPARFKAKFVGDPALVLNDIHKKIALVKKLAFAFGDRNCSTITLQNI
TRGSIVVEWTNNTLPLEPCPKEQIAGLSRRIAEDDGKPRPAFSNALEPDF
KATSITVTGSGSCRHLQFIPVVPPRRVPSEAPPTEVPDRDPEKSSEDDVY
LHTVIPAVVVAAILLIAGIIAMICYRKKRKGKLTLEDQATFIKKGVPIIF
ADELDDSKPPPSSSMPLILQEEKAPLPPPEYPNQSVPETTPLNQDTMGEY
TPLRDEDPNAPPYQPPPPFTAPMEGKGSRPKNMTPYRSPPPYVPP

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, синапсах. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Jung D., Yang B., Meyer J., Chamberlain J.S., Campbell K.P. (1995). Identification and characterization of the dystrophin anchoring site on beta-dystroglycan. J. Biol. Chem. 270: 27305—27310. PMID 7592992 DOI:10.1074/jbc.270.45.27305
  • Tommasi di Vignano A., Di Zenzo G., Sudol M., Cesareni G., Dente L. (2000). Contribution of the different modules in the utrophin carboxy-terminal region to the formation and regulation of the DAP complex. FEBS Lett. 471: 229—234. PMID 10767429 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01400-9
  • Ilsley J.L., Sudol M., Winder S.J. (2001). The interaction of dystrophin with beta-dystroglycan is regulated by tyrosine phosphorylation. Cell. Signal. 13: 625—632. PMID 11495720 DOI:10.1016/S0898-6568(01)00188-7
  • Watanabe N., Sasaoka T., Noguchi S., Nishino I., Tanaka T. (2007). Cys669-Cys713 disulfide bridge formation is a key to dystroglycan cleavage and subunit association. Genes Cells. 12: 75—88. PMID 17212656 DOI:10.1111/j.1365-2443.2006.01033.x
  • Rojek J.M., Spiropoulou C.F., Campbell K.P., Kunz S. (2007). Old World and clade C New World arenaviruses mimic the molecular mechanism of receptor recognition used by alpha-dystroglycan's host-derived ligands. J. Virol. 81: 5685—5695. PMID 17360738 DOI:10.1128/JVI.02574-06

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з DAG1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2666 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q14118 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські