C-Raf

edit
Viralni onkogen V-raf-1 leukemije glodara, homolog 1

PDB prikaz baziran na 1c1y.
Dostupne strukture
1C1Y, 1FAQ, 1FAR, 1GUA, 1RFA, 3CU8, 3IQJ, 3IQU, 3IQV, 3KUC, 3KUD, 3NKX, 3O8I, 3OMV
Identifikatori
SimboliRAF1; CRAF; NS5; Raf-1; c-Raf
Vanjski IDOMIM: 164760 MGI: 97847 HomoloGene: 48145 GeneCards: RAF1 Gene
EC broj2.7.11.1
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje nukleotida
aktivnost proteinske kinaze
aktivnost serin/treoninske proteinske kinaze
aktivnost MAP kinaze kinaze kinaze
aktivnost receptora signalnog proteina
proteinsko vezivanje
ATP vezivanje
vezivanje Ras GTPaze
vezivanje mitogen-aktivirane proteinske kinaze kinaze
vezivanje metalnog jon
aktivnost proteinske heterodimerizacije
Celularna komponenta nerastvorna frakcija
jedro
citoplazma
mitohondrija
mitohondrijska spoljašnja membrana
citozol
ćelijska membrana
pseudopodijum
Biološki proces MAPK kaskada
aktivacija MAPKK aktivnosti
respons na hipoksiju
proteinska fosforilacija
apoptotički proces
organizacija citoskeletona
prenos signala
signalni put receptora epidermalnog faktora rasta
malom GTPazom posredovani prenos signala
Prenos signala Ras proteina
sinaptička transmisija
navođenje aksona
razvoj srca
koagulacija krvi
ćelijska proliferacija
negativna regulacija ćelijske proliferacije
signalni put insulinskog receptora
signalni put fibroblastnog faktora rasta
aktivacija trombocita
negativna regulacija formiranja proteinskog kompleksa
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez5894110157
EnsemblENSG00000132155ENSMUSG00000000441
UniProtP04049Q99N57
RefSeq (mRNA)NM_002880.3NM_029780.3
RefSeq (protein)NP_002871.1NP_084056.1
Lokacija (UCSC)Chr 3:
12.63 - 12.71 Mb
Chr 6:
115.57 - 115.63 Mb
PubMed pretraga[1][2]

RAF proto-onkogena serin/treoninska proteinska kinaza (proto-onkogen c-RAF ili c-Raf) je enzim[1] koji je kod ljudi kodiran Gene|RAF1 genom.[2][3] c-Raf protein funkcioniše u MAPK/ERK signal putu kao deo kaskade proteinskih kinaza. c-Raf je član familije Raf kinaza koje su serin/treonin-specifične proteinske kinaze.

Funkcija

c-Raf je MAP kinaza kinaza kinaza (MAP3K) koja deluje niže u signalnom putu od Ras potfamilije za membranu vezanih GTPaza za koje se direktno vezuje. Nakon aktivacije Raf-1 može da fosforiliše i time aktivira proteinske kinaze dualne specifičnosti MEK1 i MEK2, koje zatim, fosforilišu serin/treonin specifične proteinske kinaze ERK1 i ERK2. Aktivirane ERK kinaze su pleiotropni efektori ćelijske fiziologije i imaju važnu ulogu u kontroli izražavanja gena koji učestvuju u ćelijskoj deobi, apoptozi, diferencijaciji, i migraciji.[4]

Reference

  1. Li P, Wood K, Mamon H, Haser W, Roberts T (February 1991). „Raf-1: a kinase currently without a cause but not lacking in effects”. Cell 64 (3): 479–82. DOI:10.1016/0092-8674(91)90228-Q. PMID 1846778. 
  2. Rapp UR, Goldsborough MD, Mark GE, Bonner TI, Groffen J, Reynolds FH, Stephenson JR (July 1983). „Structure and biological activity of v-raf, a unique oncogene transduced by a retrovirus”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80 (14): 4218–22. DOI:10.1073/pnas.80.14.4218. PMC 384008. PMID 6308607. 
  3. Bonner T, O'Brien SJ, Nash WG, Rapp UR, Morton CC, Leder P (January 1984). „The human homologs of the raf (mil) oncogene are located on human chromosomes 3 and 4”. Science 223 (4631): 71–4. DOI:10.1126/science.6691137. PMID 6691137. 
  4. „Entrez Gene: RAF1 v-raf-1 murine leukemia viral oncogene homolog 1”. 

Literatura

  • Reed JC, Zha H, Aime-Sempe C, et al. (1997). „Structure-function analysis of Bcl-2 family proteins. Regulators of programmed cell death”. Adv. Exp. Med. Biol. 406: 99–112. PMID 8910675. 
  • Geyer M, Fackler OT, Peterlin BM (2001). „Structure–function relationships in HIV-1 Nef”. EMBO Rep. 2 (7): 580–5. DOI:10.1093/embo-reports/kve141. PMC 1083955. PMID 11463741. 
  • Dhillon AS, Kolch W (2002). „Untying the regulation of the Raf-1 kinase”. Arch. Biochem. Biophys. 404 (1): 3–9. DOI:10.1016/S0003-9861(02)00244-8. PMID 12127063. 
  • Greenway AL, Holloway G, McPhee DA, et al. (2004). „HIV-1 Nef control of cell signalling molecules: multiple strategies to promote virus replication”. J. Biosci. 28 (3): 323–35. DOI:10.1007/BF02970151. PMID 12734410. 
  • Herbert Chen; Muthusamy Kunnimalaiyaan; Jamie J. Van Gompel (2006). „Medullary thyroid cancer: the functions of raf-1 and human achaete-scute homologue-1”. Thyroid 15 (6): 511–21. DOI:10.1089/thy.2005.15.511. PMID 16029117. 

Vanjske veze

  • MeSH c-raf+Proteins
  • Noonan syndrome
  • Dijagrami
  • Drosophila
  • p
  • r
  • u
PDB Galerija
Šablon:PDB Galerija/5894
  • p
  • r
  • u
  • p
  • r
  • u
(1) Serin/treonin-specifične proteinske kinaze (EC 2.7.11.1-EC 2.7.11.20)
Nespecifična serin/treonin proteinske kinaze (EC 2.7.11.1)
LATS1, LATS2, MAST1, MAST2, STK38, STK38L, CIT, ROCK1, SGK, SGK2, SGK3, Proteinska kinaza B (AKT1, AKT2, AKT3), Ataksija telangiektazija mutirani, Sisarski cilj rapamicina, EIF-2 kinaze (PKR, HRI), Wee1 (WEE1)
Piruvat dehidrogenazna kinaza (EC 2.7.11.2)
Defosfo-(reduktaza kinaza) kinaza (EC 2.7.11.3)
(3-metil-2-oksobutanoat dehidrogenaza (prenos acetila)) (EC 2.7.11.4)
BCKDK, BCKDHA, BCKDHB
(izocitrat dehidrogenaza (NADP+)) kinaza (EC 2.7.11.5)
IDH2, IDH3A, IDH3B, IDH3G
tirozin 3-monooksigenazna kinaza (EC 2.7.11.6)
Miozin-teški-lanac kinaza (EC 2.7.11.7)
Aurora kinaza (Aurora A kinaza, Aurora B kinaza)
Goodpasture-antigen-vezujuća proteinska kinaza (EC 2.7.11.9)
-
IκB kinaza (EC 2.7.11.10)
CHUK, IKK2, TBK1, IKBKE, IKBKG, IKBKAP
Proteinska kinaza A, PRKACG, PRKACB, PRKACA, PRKY
Protein kinaza C (EC 2.7.11.13)
Protein kinaza C, Protein kinaza Cζ, PKC alfa, PRKCB1, PRKCD, PRKCE, PRKCH, PRKCG, PRKCI, PRKCQ, Proteinska zavisna proteinska N1, PKN2, PKN3,
Rodopsinska kinaza (EC 2.7.11.14)
Beta adrenergički receptor kinaza (EC 2.7.11.15)
Beta adrenergički receptor kinaza, Beta adrenergički receptor kinaza-2
Ca2+/kalmodulin-zavisna (EC 2.7.11.17)
BRSK2, CAMK1, CAMK2A, CAMK2B, CAMK2D, CAMK2G, CAMK4, MLCK, CASK, CHEK1, CHEK2, DAPK1, DAPK2, DAPK3, STK11, MAPKAPK2, MAPKAPK3, MAPKAPK5, MARK1, MARK2, MARK3, MARK4, MELK, MKNK1, MKNK2, NUAK1, NUAK2, OBSCN, PASK, PHKG1, PHKG2, PIM1, PIM2, PKD1, PRKD2, PRKD3, PSKH1, SNF1LK2, KIAA0999, STK40, SNF1LK, SNRK, SPEG, TSSK2, Kalirin, TRIB1, TRIB2, TRIB3, TRIO, Titin, DCLK1
MYLK, MYLK2, MYLK3, MYLK4
Fosforilazna kinaza (EC 2.7.11.19)
PHKA1, PHKA2, PHKB, PHKG1, PHKG2
Faktor elongacije 2 kinaza (EC 2.7.11.20)
Polo kinaza (EC 2.7.11.21)
PLK1, PLK2, PLK3, PLK4
  • p
  • r
  • u
(2) Serin/treonin-specifične proteinske kinaze (EC 2.7.11.21-EC 2.7.11.30)
Polo kinaza (EC 2.7.11.21)
PLK1, PLK2, PLK3, PLK4
Ciklin-zavisna kinaza (EC 2.7.11.22)
CDK1, CDK2, CDKL2, CDK3, CDK4, CDK5, CDKL5, CDK6, CDK7, CDK8, CDK9, CDK10, CDC2L5, CRKRS, PCTK1, PCTK2, PCTK3, PFTK1, CDC2L1
(RNK-polimerazna)-podjedinica kinaza (EC 2.7.11.23)
RPS6KA5, RPS6KA4, P70S6 kinaza, P70-S6 kinaza 1, RPS6KB2, RPS6KA2, RPS6KA3, RPS6KA1, RPS6KC1
Ekstracelularnim signalom regulisane (MAPK1, MAPK3, MAPK4, MAPK6, MAPK7, MAPK12, MAPK15), C-Jun N-terminal (MAPK8, MAPK9, MAPK10), P38 mitogenom-aktivirani protein (MAPK11, MAPK13, MAPK14)
MAP3K (EC 2.7.11.25)
MAP kinaza kinaza kinaze (MAP3K1, MAP3K2, MAP3K3, MAP3K4, MAP3K5, MAP3K6, MAP3K7, MAP3K8) RAFs (ARAF, BRAF, KSR1, KSR2), MLK (MAP3K12, MAP3K13, MAP3K9, MAP3K10, MAP3K11, MAP3K7, ZAK), CDC7, MAP3K14
Tau-proteinska kinaza (EC 2.7.11.26)
TPK1, TTK, GSK-3
acetil-CoA karboksilazna kinaza] (EC 2.7.11.27)
-
Tropomiozinska kinaza (EC 2.7.11.28)
-
Receptor lipoproteina-niske-gustine kinaza (EC 2.7.11.29)
-
Receptor protein serin/treonin kinaza (EC 2.7.11.30)
Koštani morfogenetski proteinski receptori (BMPR1, BMPR1A, BMPR1B, BMPR2), ACVR1, ACVR1B, ACVR1C, ACVR2A, ACVR2B, ACVRL1, Anti-Mulerianski hormonski receptor
  • p
  • r
  • u
(3) Kinaze dualne-specifičnosti (EC 2.7.12)
MAP2K1, MAP2K2, MAP2K3, MAP2K4, MAP2K5, MAP2K6, MAP2K7
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
Ligand
Epidermalni faktor rasta
Receptor
Drugi
GRB2  SOS  RAS  RAF  MEK  MAPK  MNK  RSK
B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)
  • p
  • r
  • u
Teme
Tipovi
EC1 Oksidoreduktaze/spisak  • EC2 Transferaze/spisak  • EC3 Hidrolaze/spisak  • EC4 Lijaze/spisak  • EC5 Izomeraze/spisak  • EC6 Ligaze/spisak
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6